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圖為油菜液相育種芯片。（受訪(fǎng)者供圖）
“一堆種子擺在面前，哪種長(cháng)出來(lái)的植株更高？哪種產(chǎn)量高？哪種不容易生病蟲(chóng)害？這些信息在育種芯片里都能找到答案。”論文通訊作者、西南大學(xué)農學(xué)與生物科技學(xué)院教授盧坤介紹，育種芯片是生物物種基因檢測的重要工具，在畜禽和農作物遺傳改良與育種研究中發(fā)揮著(zhù)重要作用。研究人員通過(guò)育種芯片可了解這類(lèi)種子的大部分特性，從而指導品種培育工作。目前育種芯片在小麥和玉米等農作物中應用較為廣泛，但在油菜上的相關(guān)研究和應用則較少，且主要依靠固相育種芯片來(lái)提供檢測數據。
2014年起，盧坤帶領(lǐng)的研究團隊選取了588份有代表性的油菜品種進(jìn)行全基因組重測序，并從挖掘的500多萬(wàn)個(gè)變異位點(diǎn)中篩選出5萬(wàn)多個(gè)位點(diǎn)，設計了首款液相育種芯片。驗證顯示，液相育種芯片能夠針對同一個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行多次檢測，準確性相比傳統的固相芯片更高，成本則僅為后者的十分之一到五分之一，能夠更好地為油菜靶向捕獲測序、遺傳分析和基因組育種提供基因組學(xué)資源。
圖為盧坤在油菜試驗田里進(jìn)行取樣作業(yè)。新華社記者王全超 攝
“這項研究成果對開(kāi)展油菜基因組設計育種、提高我國油菜生物育種水平具有重要意義。”中國遺傳學(xué)會(huì )植物與基因組專(zhuān)業(yè)委員會(huì )委員李加納認為，液相芯片的使用為開(kāi)展基因組設計育種工作打下基礎，還可以利用育種芯片對品種進(jìn)行監測，有助于提高育種效率，設計培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)的油菜新品種。
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